治疗肛瘘的药物有润滑肠道的药物，比如乳果糖口服溶液，同时也可以通过蒙脱石散药物治疗，如果比较严重，抗生素类的药物也能起到很好的治疗效果。
1、乳果糖口服溶液：如果在平时生活中经常吃辛辣刺激性的食物，可能会影响正常的排便，同时也会导致肛瘘疾病加重，通过乳果糖口服溶液能够软化大便，可以将肠道当中的垃圾排出体外，能够减少对肛门的刺激，所以对肛瘘疾病的治疗有很大的好处。
2、蒙脱石散：出现肛瘘可能会导致患者出现拉肚子，严重会导致肛门部位出现灼热感和疼痛感，通过蒙脱石散药物可以起到止泻的效果，但是需要遵医嘱，根据病情的严重程度来及时调整用药量。
3、抗生素：肛瘘是因为炎症所引起的症状，抗生素能起到很好的杀菌效果，所以对肛瘘的治疗也能有一定的好处。
在日常生活中需要多吃一些新鲜的蔬菜和水果，也可以多吃一些纤维素高的食物，比如虾肉、竹笋、青菜，有些食物可以促进肠道蠕动，也可以提供身体所需营养，并不会影响正常的排便，也不会导致便秘。
