由于感染原因尚不清楚，细菌或病毒感染的患者在感染期间或感染后往往会出现全血细胞减少，而细菌或病毒感染的患者往往会使用抗生素等药物治疗，因此很难确定再生障碍性贫血是感染的结果，是药物引起的还是两者结合的，有时甚至感染性疾病都是由全血细胞减少而不是病因引起的。肝炎患者可以产生多种抗体，其中许多抗体在组织间具有交叉反应性，抗体的产生使宿主自身的识别系统功能障碍，导致骨髓衰竭。